Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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