Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms