Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pcbp2Q61990 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms