Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hes3Q61657 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hes3Q61657 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hes3Q61657 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hes3Q61657 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hes3Q61657 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hes3Q61657 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms