Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim25Q61510 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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