Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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