Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms