Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms