Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms