Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms