Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf123Q5XPI3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms