Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp20Q5XG71 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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