Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim38Q5SZ99 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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