Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms