Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps54Q5SPW0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps54Q5SPW0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms