Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms