Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Trappc1Q5NCF2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Trappc1Q5NCF2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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