Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3kQ5GIG6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms