Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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