Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm4Q4VBF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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