Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx25Q3ZT31 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx25Q3ZT31 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx25Q3ZT31 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx25Q3ZT31 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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