Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms