Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms