Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnpc3Q3UZ01 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnpc3Q3UZ01 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms