Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms