Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CrxosQ3UL53 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms