Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm648Q3UJ22 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms