Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms