Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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