Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms