Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms