Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms