Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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