Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rhox4fQ2MDF8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rhox4fQ2MDF8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms