Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Arhgap9Q1HDU4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms