Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms