Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms