Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms