Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cib3Q0P523 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms