Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdf3Q07104 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms