Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms