Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms