Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms