Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms