Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms