Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms