Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms