Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms