Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms