Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms